Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
SP6Q3SY56 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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SP6Q3SY56 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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SP6Q3SY56 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
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SP6Q3SY56 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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SP6Q3SY56 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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SP6Q3SY56 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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SP6Q3SY56 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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SP6Q3SY56 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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SP6Q3SY56 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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SP6Q3SY56 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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