Protein–RNA interactions for Protein: Q16563

SYPL1, Synaptophysin-like protein 1, humanhuman

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Length 259 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYPL1Q16563 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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