Protein–RNA interactions for Protein: Q15645

TRIP13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP13Q15645 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIP13Q15645 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms