Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
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