Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NFIXQ14938 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NFIXQ14938 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NFIXQ14938 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NFIXQ14938 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NFIXQ14938 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NFIXQ14938 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NFIXQ14938 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NFIXQ14938 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
NFIXQ14938 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NFIXQ14938 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
NFIXQ14938 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NFIXQ14938 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
NFIXQ14938 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NFIXQ14938 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NFIXQ14938 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NFIXQ14938 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NFIXQ14938 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NFIXQ14938 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NFIXQ14938 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NFIXQ14938 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
NFIXQ14938 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NFIXQ14938 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NFIXQ14938 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
NFIXQ14938 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NFIXQ14938 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NFIXQ14938 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NFIXQ14938 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NFIXQ14938 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NFIXQ14938 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NFIXQ14938 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NFIXQ14938 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NFIXQ14938 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NFIXQ14938 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NFIXQ14938 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NFIXQ14938 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NFIXQ14938 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NFIXQ14938 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NFIXQ14938 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NFIXQ14938 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NFIXQ14938 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NFIXQ14938 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NFIXQ14938 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NFIXQ14938 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NFIXQ14938 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
NFIXQ14938 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
NFIXQ14938 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
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NFIXQ14938 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NFIXQ14938 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NFIXQ14938 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NFIXQ14938 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NFIXQ14938 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NFIXQ14938 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NFIXQ14938 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NFIXQ14938 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
NFIXQ14938 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NFIXQ14938 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NFIXQ14938 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NFIXQ14938 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NFIXQ14938 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NFIXQ14938 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NFIXQ14938 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NFIXQ14938 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NFIXQ14938 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NFIXQ14938 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
NFIXQ14938 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NFIXQ14938 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NFIXQ14938 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
NFIXQ14938 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
NFIXQ14938 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NFIXQ14938 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NFIXQ14938 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NFIXQ14938 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NFIXQ14938 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
NFIXQ14938 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NFIXQ14938 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NFIXQ14938 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NFIXQ14938 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NFIXQ14938 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NFIXQ14938 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NFIXQ14938 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NFIXQ14938 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NFIXQ14938 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NFIXQ14938 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NFIXQ14938 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NFIXQ14938 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NFIXQ14938 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NFIXQ14938 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NFIXQ14938 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NFIXQ14938 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NFIXQ14938 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NFIXQ14938 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NFIXQ14938 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NFIXQ14938 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NFIXQ14938 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
NFIXQ14938 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NFIXQ14938 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
NFIXQ14938 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NFIXQ14938 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
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