Protein–RNA interactions for Protein: Q14761

PTPRCAP, Protein tyrosine phosphatase receptor type C-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAPQ14761 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRCAPQ14761 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRCAPQ14761 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRCAPQ14761 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRCAPQ14761 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRCAPQ14761 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRCAPQ14761 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRCAPQ14761 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRCAPQ14761 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRCAPQ14761 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRCAPQ14761 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRCAPQ14761 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRCAPQ14761 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRCAPQ14761 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRCAPQ14761 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRCAPQ14761 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRCAPQ14761 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRCAPQ14761 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRCAPQ14761 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRCAPQ14761 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRCAPQ14761 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRCAPQ14761 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRCAPQ14761 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRCAPQ14761 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRCAPQ14761 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRCAPQ14761 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRCAPQ14761 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRCAPQ14761 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRCAPQ14761 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRCAPQ14761 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRCAPQ14761 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRCAPQ14761 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRCAPQ14761 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRCAPQ14761 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRCAPQ14761 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRCAPQ14761 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRCAPQ14761 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRCAPQ14761 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRCAPQ14761 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRCAPQ14761 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRCAPQ14761 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRCAPQ14761 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRCAPQ14761 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRCAPQ14761 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRCAPQ14761 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRCAPQ14761 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRCAPQ14761 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRCAPQ14761 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRCAPQ14761 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRCAPQ14761 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRCAPQ14761 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRCAPQ14761 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRCAPQ14761 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRCAPQ14761 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRCAPQ14761 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRCAPQ14761 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRCAPQ14761 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRCAPQ14761 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRCAPQ14761 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRCAPQ14761 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRCAPQ14761 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRCAPQ14761 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRCAPQ14761 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRCAPQ14761 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRCAPQ14761 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRCAPQ14761 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRCAPQ14761 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRCAPQ14761 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRCAPQ14761 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRCAPQ14761 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PTPRCAPQ14761 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PTPRCAPQ14761 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
PTPRCAPQ14761 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PTPRCAPQ14761 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PTPRCAPQ14761 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PTPRCAPQ14761 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PTPRCAPQ14761 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PTPRCAPQ14761 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PTPRCAPQ14761 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PTPRCAPQ14761 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PTPRCAPQ14761 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PTPRCAPQ14761 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTPRCAPQ14761 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTPRCAPQ14761 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTPRCAPQ14761 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTPRCAPQ14761 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTPRCAPQ14761 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTPRCAPQ14761 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTPRCAPQ14761 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTPRCAPQ14761 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTPRCAPQ14761 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTPRCAPQ14761 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTPRCAPQ14761 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTPRCAPQ14761 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTPRCAPQ14761 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTPRCAPQ14761 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTPRCAPQ14761 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTPRCAPQ14761 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTPRCAPQ14761 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTPRCAPQ14761 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms