Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTCH1Q13635 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PTCH1Q13635 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PTCH1Q13635 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PTCH1Q13635 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PTCH1Q13635 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PTCH1Q13635 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
PTCH1Q13635 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTCH1Q13635 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTCH1Q13635 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTCH1Q13635 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PTCH1Q13635 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTCH1Q13635 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTCH1Q13635 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTCH1Q13635 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PTCH1Q13635 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTCH1Q13635 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTCH1Q13635 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTCH1Q13635 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PTCH1Q13635 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PTCH1Q13635 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PTCH1Q13635 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTCH1Q13635 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTCH1Q13635 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTCH1Q13635 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PTCH1Q13635 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PTCH1Q13635 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PTCH1Q13635 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PTCH1Q13635 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTCH1Q13635 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PTCH1Q13635 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PTCH1Q13635 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTCH1Q13635 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PTCH1Q13635 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTCH1Q13635 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PTCH1Q13635 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTCH1Q13635 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PTCH1Q13635 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTCH1Q13635 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTCH1Q13635 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PTCH1Q13635 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTCH1Q13635 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTCH1Q13635 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PTCH1Q13635 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PTCH1Q13635 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PTCH1Q13635 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PTCH1Q13635 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTCH1Q13635 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PTCH1Q13635 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PTCH1Q13635 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PTCH1Q13635 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PTCH1Q13635 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PTCH1Q13635 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTCH1Q13635 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PTCH1Q13635 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PTCH1Q13635 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTCH1Q13635 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTCH1Q13635 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTCH1Q13635 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTCH1Q13635 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTCH1Q13635 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PTCH1Q13635 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTCH1Q13635 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTCH1Q13635 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PTCH1Q13635 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PTCH1Q13635 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PTCH1Q13635 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTCH1Q13635 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTCH1Q13635 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTCH1Q13635 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PTCH1Q13635 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTCH1Q13635 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTCH1Q13635 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PTCH1Q13635 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTCH1Q13635 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTCH1Q13635 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PTCH1Q13635 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PTCH1Q13635 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PTCH1Q13635 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PTCH1Q13635 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTCH1Q13635 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PTCH1Q13635 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PTCH1Q13635 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
PTCH1Q13635 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PTCH1Q13635 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PTCH1Q13635 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTCH1Q13635 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PTCH1Q13635 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PTCH1Q13635 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PTCH1Q13635 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PTCH1Q13635 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTCH1Q13635 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTCH1Q13635 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PTCH1Q13635 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PTCH1Q13635 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTCH1Q13635 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PTCH1Q13635 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PTCH1Q13635 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PTCH1Q13635 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTCH1Q13635 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
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