Protein–RNA interactions for Protein: Q13609

DNASE1L3, Deoxyribonuclease gamma, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNASE1L3Q13609 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 160.8 ms