Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NEUROD1Q13562 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEUROD1Q13562 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEUROD1Q13562 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEUROD1Q13562 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NEUROD1Q13562 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEUROD1Q13562 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEUROD1Q13562 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEUROD1Q13562 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEUROD1Q13562 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEUROD1Q13562 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEUROD1Q13562 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEUROD1Q13562 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEUROD1Q13562 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEUROD1Q13562 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEUROD1Q13562 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEUROD1Q13562 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEUROD1Q13562 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEUROD1Q13562 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEUROD1Q13562 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEUROD1Q13562 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEUROD1Q13562 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEUROD1Q13562 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEUROD1Q13562 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEUROD1Q13562 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEUROD1Q13562 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEUROD1Q13562 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEUROD1Q13562 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEUROD1Q13562 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEUROD1Q13562 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEUROD1Q13562 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEUROD1Q13562 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEUROD1Q13562 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
NEUROD1Q13562 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEUROD1Q13562 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEUROD1Q13562 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEUROD1Q13562 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEUROD1Q13562 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEUROD1Q13562 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEUROD1Q13562 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEUROD1Q13562 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEUROD1Q13562 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEUROD1Q13562 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEUROD1Q13562 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEUROD1Q13562 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEUROD1Q13562 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NEUROD1Q13562 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NEUROD1Q13562 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NEUROD1Q13562 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NEUROD1Q13562 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NEUROD1Q13562 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NEUROD1Q13562 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NEUROD1Q13562 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NEUROD1Q13562 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NEUROD1Q13562 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NEUROD1Q13562 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NEUROD1Q13562 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NEUROD1Q13562 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NEUROD1Q13562 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
NEUROD1Q13562 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NEUROD1Q13562 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
NEUROD1Q13562 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NEUROD1Q13562 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NEUROD1Q13562 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NEUROD1Q13562 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NEUROD1Q13562 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NEUROD1Q13562 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NEUROD1Q13562 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NEUROD1Q13562 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NEUROD1Q13562 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NEUROD1Q13562 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NEUROD1Q13562 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEUROD1Q13562 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEUROD1Q13562 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEUROD1Q13562 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEUROD1Q13562 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEUROD1Q13562 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEUROD1Q13562 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEUROD1Q13562 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEUROD1Q13562 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEUROD1Q13562 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEUROD1Q13562 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEUROD1Q13562 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
NEUROD1Q13562 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEUROD1Q13562 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEUROD1Q13562 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
NEUROD1Q13562 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEUROD1Q13562 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEUROD1Q13562 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEUROD1Q13562 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEUROD1Q13562 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEUROD1Q13562 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEUROD1Q13562 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEUROD1Q13562 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEUROD1Q13562 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEUROD1Q13562 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NEUROD1Q13562 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NEUROD1Q13562 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NEUROD1Q13562 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NEUROD1Q13562 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
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