Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNMA1Q12791 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNMA1Q12791 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNMA1Q12791 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNMA1Q12791 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNMA1Q12791 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNMA1Q12791 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNMA1Q12791 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNMA1Q12791 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNMA1Q12791 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNMA1Q12791 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNMA1Q12791 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNMA1Q12791 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNMA1Q12791 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNMA1Q12791 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNMA1Q12791 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNMA1Q12791 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNMA1Q12791 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNMA1Q12791 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNMA1Q12791 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNMA1Q12791 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNMA1Q12791 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNMA1Q12791 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNMA1Q12791 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNMA1Q12791 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNMA1Q12791 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNMA1Q12791 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNMA1Q12791 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNMA1Q12791 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNMA1Q12791 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNMA1Q12791 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNMA1Q12791 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNMA1Q12791 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KCNMA1Q12791 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KCNMA1Q12791 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KCNMA1Q12791 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KCNMA1Q12791 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KCNMA1Q12791 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KCNMA1Q12791 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KCNMA1Q12791 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KCNMA1Q12791 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KCNMA1Q12791 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KCNMA1Q12791 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KCNMA1Q12791 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KCNMA1Q12791 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KCNMA1Q12791 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KCNMA1Q12791 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KCNMA1Q12791 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KCNMA1Q12791 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
KCNMA1Q12791 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
KCNMA1Q12791 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KCNMA1Q12791 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
KCNMA1Q12791 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
KCNMA1Q12791 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KCNMA1Q12791 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KCNMA1Q12791 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KCNMA1Q12791 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KCNMA1Q12791 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KCNMA1Q12791 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KCNMA1Q12791 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KCNMA1Q12791 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KCNMA1Q12791 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KCNMA1Q12791 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KCNMA1Q12791 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KCNMA1Q12791 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
KCNMA1Q12791 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
KCNMA1Q12791 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
KCNMA1Q12791 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
KCNMA1Q12791 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
KCNMA1Q12791 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
KCNMA1Q12791 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
KCNMA1Q12791 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNMA1Q12791 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNMA1Q12791 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNMA1Q12791 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNMA1Q12791 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNMA1Q12791 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNMA1Q12791 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNMA1Q12791 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNMA1Q12791 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNMA1Q12791 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNMA1Q12791 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNMA1Q12791 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNMA1Q12791 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNMA1Q12791 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNMA1Q12791 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNMA1Q12791 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNMA1Q12791 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNMA1Q12791 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNMA1Q12791 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNMA1Q12791 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNMA1Q12791 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNMA1Q12791 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNMA1Q12791 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNMA1Q12791 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNMA1Q12791 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNMA1Q12791 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNMA1Q12791 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNMA1Q12791 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNMA1Q12791 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms