Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms