Protein–RNA interactions for Protein: P41229

KDM5C, Lysine-specific demethylase 5C, humanhuman

Predictions only

Length 1,560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5CP41229 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KDM5CP41229 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KDM5CP41229 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KDM5CP41229 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KDM5CP41229 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KDM5CP41229 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KDM5CP41229 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KDM5CP41229 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KDM5CP41229 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KDM5CP41229 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KDM5CP41229 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KDM5CP41229 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KDM5CP41229 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
KDM5CP41229 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
KDM5CP41229 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KDM5CP41229 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
KDM5CP41229 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KDM5CP41229 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KDM5CP41229 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDM5CP41229 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDM5CP41229 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDM5CP41229 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDM5CP41229 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDM5CP41229 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDM5CP41229 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDM5CP41229 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDM5CP41229 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDM5CP41229 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDM5CP41229 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDM5CP41229 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDM5CP41229 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDM5CP41229 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
KDM5CP41229 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDM5CP41229 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDM5CP41229 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDM5CP41229 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDM5CP41229 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDM5CP41229 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
KDM5CP41229 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDM5CP41229 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDM5CP41229 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDM5CP41229 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDM5CP41229 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDM5CP41229 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDM5CP41229 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KDM5CP41229 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
KDM5CP41229 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
KDM5CP41229 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.27
KDM5CP41229 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
KDM5CP41229 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KDM5CP41229 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KDM5CP41229 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KDM5CP41229 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KDM5CP41229 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KDM5CP41229 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KDM5CP41229 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KDM5CP41229 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KDM5CP41229 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KDM5CP41229 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KDM5CP41229 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KDM5CP41229 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KDM5CP41229 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KDM5CP41229 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KDM5CP41229 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
KDM5CP41229 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KDM5CP41229 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KDM5CP41229 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
KDM5CP41229 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KDM5CP41229 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KDM5CP41229 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KDM5CP41229 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KDM5CP41229 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KDM5CP41229 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KDM5CP41229 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KDM5CP41229 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KDM5CP41229 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KDM5CP41229 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KDM5CP41229 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KDM5CP41229 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KDM5CP41229 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KDM5CP41229 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KDM5CP41229 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KDM5CP41229 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
KDM5CP41229 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
KDM5CP41229 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KDM5CP41229 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
KDM5CP41229 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KDM5CP41229 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
KDM5CP41229 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KDM5CP41229 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
KDM5CP41229 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KDM5CP41229 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KDM5CP41229 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
KDM5CP41229 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KDM5CP41229 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KDM5CP41229 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KDM5CP41229 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KDM5CP41229 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KDM5CP41229 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KDM5CP41229 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms