Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GCAP28676 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GCAP28676 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GCAP28676 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GCAP28676 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GCAP28676 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GCAP28676 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GCAP28676 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GCAP28676 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GCAP28676 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GCAP28676 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GCAP28676 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GCAP28676 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GCAP28676 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GCAP28676 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GCAP28676 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GCAP28676 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GCAP28676 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GCAP28676 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GCAP28676 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GCAP28676 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GCAP28676 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GCAP28676 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GCAP28676 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GCAP28676 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GCAP28676 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GCAP28676 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GCAP28676 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GCAP28676 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GCAP28676 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GCAP28676 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GCAP28676 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GCAP28676 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GCAP28676 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GCAP28676 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GCAP28676 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GCAP28676 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
GCAP28676 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GCAP28676 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GCAP28676 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GCAP28676 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GCAP28676 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GCAP28676 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GCAP28676 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GCAP28676 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GCAP28676 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GCAP28676 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
GCAP28676 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
GCAP28676 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GCAP28676 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GCAP28676 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GCAP28676 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GCAP28676 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GCAP28676 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GCAP28676 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GCAP28676 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GCAP28676 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GCAP28676 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GCAP28676 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
GCAP28676 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GCAP28676 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GCAP28676 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GCAP28676 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GCAP28676 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GCAP28676 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GCAP28676 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GCAP28676 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GCAP28676 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GCAP28676 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GCAP28676 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GCAP28676 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GCAP28676 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GCAP28676 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GCAP28676 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GCAP28676 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
GCAP28676 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GCAP28676 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GCAP28676 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GCAP28676 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GCAP28676 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GCAP28676 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
GCAP28676 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GCAP28676 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GCAP28676 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GCAP28676 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GCAP28676 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GCAP28676 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GCAP28676 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GCAP28676 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GCAP28676 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GCAP28676 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GCAP28676 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GCAP28676 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GCAP28676 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GCAP28676 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GCAP28676 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GCAP28676 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GCAP28676 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GCAP28676 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GCAP28676 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms