Protein–RNA interactions for Protein: P28066

PSMA5, Proteasome subunit alpha type-5, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA5P28066 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PSMA5P28066 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PSMA5P28066 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
PSMA5P28066 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PSMA5P28066 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PSMA5P28066 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PSMA5P28066 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PSMA5P28066 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PSMA5P28066 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PSMA5P28066 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PSMA5P28066 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PSMA5P28066 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
PSMA5P28066 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PSMA5P28066 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PSMA5P28066 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PSMA5P28066 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PSMA5P28066 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PSMA5P28066 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
PSMA5P28066 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
PSMA5P28066 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
PSMA5P28066 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
PSMA5P28066 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PSMA5P28066 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PSMA5P28066 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PSMA5P28066 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PSMA5P28066 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PSMA5P28066 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PSMA5P28066 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PSMA5P28066 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
PSMA5P28066 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PSMA5P28066 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PSMA5P28066 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PSMA5P28066 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PSMA5P28066 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PSMA5P28066 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PSMA5P28066 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
PSMA5P28066 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PSMA5P28066 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PSMA5P28066 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PSMA5P28066 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PSMA5P28066 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
PSMA5P28066 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PSMA5P28066 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PSMA5P28066 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PSMA5P28066 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PSMA5P28066 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PSMA5P28066 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PSMA5P28066 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PSMA5P28066 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PSMA5P28066 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PSMA5P28066 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PSMA5P28066 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PSMA5P28066 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PSMA5P28066 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PSMA5P28066 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PSMA5P28066 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PSMA5P28066 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PSMA5P28066 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PSMA5P28066 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PSMA5P28066 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PSMA5P28066 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PSMA5P28066 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PSMA5P28066 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PSMA5P28066 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PSMA5P28066 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PSMA5P28066 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PSMA5P28066 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PSMA5P28066 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PSMA5P28066 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PSMA5P28066 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PSMA5P28066 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PSMA5P28066 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PSMA5P28066 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PSMA5P28066 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PSMA5P28066 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PSMA5P28066 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PSMA5P28066 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PSMA5P28066 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PSMA5P28066 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PSMA5P28066 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PSMA5P28066 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PSMA5P28066 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PSMA5P28066 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PSMA5P28066 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PSMA5P28066 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PSMA5P28066 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PSMA5P28066 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PSMA5P28066 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PSMA5P28066 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PSMA5P28066 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PSMA5P28066 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PSMA5P28066 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PSMA5P28066 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PSMA5P28066 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PSMA5P28066 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PSMA5P28066 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PSMA5P28066 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PSMA5P28066 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PSMA5P28066 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PSMA5P28066 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms