Protein–RNA interactions for Protein: P16452

EPB42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB42P16452 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPB42P16452 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPB42P16452 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPB42P16452 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPB42P16452 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPB42P16452 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPB42P16452 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPB42P16452 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPB42P16452 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPB42P16452 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPB42P16452 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPB42P16452 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPB42P16452 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPB42P16452 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPB42P16452 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPB42P16452 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPB42P16452 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPB42P16452 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
EPB42P16452 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPB42P16452 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPB42P16452 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
EPB42P16452 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPB42P16452 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPB42P16452 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPB42P16452 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPB42P16452 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPB42P16452 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPB42P16452 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
EPB42P16452 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPB42P16452 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPB42P16452 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPB42P16452 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
EPB42P16452 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPB42P16452 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPB42P16452 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPB42P16452 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPB42P16452 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
EPB42P16452 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPB42P16452 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPB42P16452 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
EPB42P16452 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPB42P16452 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPB42P16452 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPB42P16452 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPB42P16452 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPB42P16452 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPB42P16452 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPB42P16452 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPB42P16452 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPB42P16452 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPB42P16452 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
EPB42P16452 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPB42P16452 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPB42P16452 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
EPB42P16452 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
EPB42P16452 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
EPB42P16452 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
EPB42P16452 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
EPB42P16452 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
EPB42P16452 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
EPB42P16452 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
EPB42P16452 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
EPB42P16452 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
EPB42P16452 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
EPB42P16452 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
EPB42P16452 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EPB42P16452 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EPB42P16452 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EPB42P16452 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EPB42P16452 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EPB42P16452 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EPB42P16452 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EPB42P16452 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EPB42P16452 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EPB42P16452 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EPB42P16452 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EPB42P16452 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EPB42P16452 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
EPB42P16452 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EPB42P16452 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EPB42P16452 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EPB42P16452 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EPB42P16452 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
EPB42P16452 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EPB42P16452 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EPB42P16452 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EPB42P16452 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
EPB42P16452 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
EPB42P16452 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EPB42P16452 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EPB42P16452 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EPB42P16452 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EPB42P16452 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EPB42P16452 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EPB42P16452 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EPB42P16452 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EPB42P16452 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EPB42P16452 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EPB42P16452 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EPB42P16452 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms