Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

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Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRCP08575 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRCP08575 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRCP08575 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRCP08575 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRCP08575 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRCP08575 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRCP08575 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRCP08575 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRCP08575 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRCP08575 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRCP08575 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRCP08575 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRCP08575 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRCP08575 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRCP08575 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRCP08575 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRCP08575 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRCP08575 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRCP08575 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRCP08575 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRCP08575 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRCP08575 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRCP08575 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRCP08575 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRCP08575 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRCP08575 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRCP08575 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRCP08575 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRCP08575 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRCP08575 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRCP08575 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRCP08575 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRCP08575 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRCP08575 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRCP08575 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRCP08575 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRCP08575 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRCP08575 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRCP08575 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRCP08575 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRCP08575 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRCP08575 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRCP08575 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRCP08575 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRCP08575 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRCP08575 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRCP08575 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRCP08575 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRCP08575 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRCP08575 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRCP08575 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRCP08575 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRCP08575 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRCP08575 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRCP08575 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRCP08575 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRCP08575 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRCP08575 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRCP08575 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRCP08575 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRCP08575 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRCP08575 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRCP08575 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRCP08575 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRCP08575 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRCP08575 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRCP08575 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPRCP08575 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPRCP08575 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPRCP08575 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPRCP08575 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPRCP08575 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPRCP08575 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPRCP08575 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPRCP08575 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPRCP08575 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPRCP08575 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPRCP08575 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPRCP08575 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPRCP08575 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPRCP08575 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPRCP08575 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPRCP08575 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPRCP08575 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPRCP08575 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPRCP08575 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPRCP08575 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPRCP08575 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPRCP08575 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPRCP08575 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPRCP08575 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPRCP08575 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPRCP08575 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPRCP08575 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPRCP08575 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPRCP08575 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPRCP08575 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPRCP08575 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPRCP08575 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
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