Protein–RNA interactions for Protein: O43760

SYNGR2, Synaptogyrin-2, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR2O43760 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SYNGR2O43760 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SYNGR2O43760 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SYNGR2O43760 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SYNGR2O43760 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SYNGR2O43760 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SYNGR2O43760 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SYNGR2O43760 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SYNGR2O43760 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SYNGR2O43760 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SYNGR2O43760 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SYNGR2O43760 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SYNGR2O43760 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SYNGR2O43760 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SYNGR2O43760 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SYNGR2O43760 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
SYNGR2O43760 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SYNGR2O43760 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SYNGR2O43760 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SYNGR2O43760 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SYNGR2O43760 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SYNGR2O43760 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SYNGR2O43760 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SYNGR2O43760 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SYNGR2O43760 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SYNGR2O43760 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SYNGR2O43760 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SYNGR2O43760 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SYNGR2O43760 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SYNGR2O43760 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SYNGR2O43760 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SYNGR2O43760 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SYNGR2O43760 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SYNGR2O43760 RALGAPA1-201ENST00000307138 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SYNGR2O43760 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SYNGR2O43760 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SYNGR2O43760 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SYNGR2O43760 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SYNGR2O43760 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SYNGR2O43760 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SYNGR2O43760 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SYNGR2O43760 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SYNGR2O43760 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SYNGR2O43760 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SYNGR2O43760 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SYNGR2O43760 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SYNGR2O43760 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SYNGR2O43760 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SYNGR2O43760 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SYNGR2O43760 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SYNGR2O43760 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SYNGR2O43760 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SYNGR2O43760 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SYNGR2O43760 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SYNGR2O43760 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SYNGR2O43760 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SYNGR2O43760 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SYNGR2O43760 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SYNGR2O43760 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SYNGR2O43760 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SYNGR2O43760 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SYNGR2O43760 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SYNGR2O43760 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
SYNGR2O43760 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SYNGR2O43760 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SYNGR2O43760 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SYNGR2O43760 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SYNGR2O43760 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SYNGR2O43760 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SYNGR2O43760 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
SYNGR2O43760 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SYNGR2O43760 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SYNGR2O43760 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SYNGR2O43760 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SYNGR2O43760 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SYNGR2O43760 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SYNGR2O43760 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SYNGR2O43760 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SYNGR2O43760 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SYNGR2O43760 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SYNGR2O43760 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SYNGR2O43760 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SYNGR2O43760 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SYNGR2O43760 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SYNGR2O43760 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SYNGR2O43760 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SYNGR2O43760 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SYNGR2O43760 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SYNGR2O43760 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SYNGR2O43760 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SYNGR2O43760 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SYNGR2O43760 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SYNGR2O43760 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SYNGR2O43760 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SYNGR2O43760 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SYNGR2O43760 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SYNGR2O43760 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SYNGR2O43760 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SYNGR2O43760 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SYNGR2O43760 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms