Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K1

CC2D2A, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CC2D2AQ9P2K1 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CC2D2AQ9P2K1 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
CC2D2AQ9P2K1 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CC2D2AQ9P2K1 SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 1479 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CC2D2AQ9P2K1 STAG1-206ENST00000480733 1304 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CC2D2AQ9P2K1 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CC2D2AQ9P2K1 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CC2D2AQ9P2K1 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CC2D2AQ9P2K1 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CC2D2AQ9P2K1 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
CC2D2AQ9P2K1 AC114296.1-204ENST00000637197 1173 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CC2D2AQ9P2K1 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CC2D2AQ9P2K1 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CC2D2AQ9P2K1 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CC2D2AQ9P2K1 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CC2D2AQ9P2K1 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CC2D2AQ9P2K1 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
CC2D2AQ9P2K1 FAM92A-202ENST00000423990 914 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CC2D2AQ9P2K1 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CC2D2AQ9P2K1 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CC2D2AQ9P2K1 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CC2D2AQ9P2K1 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CC2D2AQ9P2K1 AC006548.2-201ENST00000605217 529 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
CC2D2AQ9P2K1 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CC2D2AQ9P2K1 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CC2D2AQ9P2K1 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CC2D2AQ9P2K1 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CC2D2AQ9P2K1 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CC2D2AQ9P2K1 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CC2D2AQ9P2K1 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CC2D2AQ9P2K1 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CC2D2AQ9P2K1 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CC2D2AQ9P2K1 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CC2D2AQ9P2K1 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CC2D2AQ9P2K1 AL132801.1-201ENST00000559675 567 ntTSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CC2D2AQ9P2K1 AC004528.1-201ENST00000588380 641 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CC2D2AQ9P2K1 AC005759.1-202ENST00000599416 415 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CC2D2AQ9P2K1 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CC2D2AQ9P2K1 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CC2D2AQ9P2K1 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CC2D2AQ9P2K1 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CC2D2AQ9P2K1 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CC2D2AQ9P2K1 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CC2D2AQ9P2K1 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CC2D2AQ9P2K1 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CC2D2AQ9P2K1 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CC2D2AQ9P2K1 ARRB2-218ENST00000575877 1579 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CC2D2AQ9P2K1 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CC2D2AQ9P2K1 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CC2D2AQ9P2K1 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CC2D2AQ9P2K1 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CC2D2AQ9P2K1 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CC2D2AQ9P2K1 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CC2D2AQ9P2K1 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CC2D2AQ9P2K1 AC019118.2-201ENST00000425776 718 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CC2D2AQ9P2K1 ROPN1B-203ENST00000505382 713 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CC2D2AQ9P2K1 TREX1-206ENST00000629913 945 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CC2D2AQ9P2K1 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CC2D2AQ9P2K1 AC079325.2-201ENST00000641710 606 ntAPPRIS P5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CC2D2AQ9P2K1 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CC2D2AQ9P2K1 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CC2D2AQ9P2K1 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CC2D2AQ9P2K1 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CC2D2AQ9P2K1 MT1E-202ENST00000330439 729 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CC2D2AQ9P2K1 HCG9-201ENST00000376800 663 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CC2D2AQ9P2K1 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CC2D2AQ9P2K1 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CC2D2AQ9P2K1 AC004895.1-203ENST00000428901 540 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CC2D2AQ9P2K1 PMEL-214ENST00000550447 901 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CC2D2AQ9P2K1 IGHV3OR15-7-201ENST00000558565 359 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CC2D2AQ9P2K1 SRP14-204ENST00000558720 780 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CC2D2AQ9P2K1 DNAJC10-211ENST00000640034 888 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CC2D2AQ9P2K1 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CC2D2AQ9P2K1 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CC2D2AQ9P2K1 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
CC2D2AQ9P2K1 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CC2D2AQ9P2K1 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CC2D2AQ9P2K1 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CC2D2AQ9P2K1 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CC2D2AQ9P2K1 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CC2D2AQ9P2K1 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CC2D2AQ9P2K1 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CC2D2AQ9P2K1 HIST1H2BJ-201ENST00000339812 381 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CC2D2AQ9P2K1 SNX15-201ENST00000352068 771 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CC2D2AQ9P2K1 RBM4-203ENST00000398692 921 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CC2D2AQ9P2K1 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
CC2D2AQ9P2K1 ATXN8OS-202ENST00000424524 1236 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CC2D2AQ9P2K1 RBM4-207ENST00000506523 654 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CC2D2AQ9P2K1 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CC2D2AQ9P2K1 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CC2D2AQ9P2K1 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CC2D2AQ9P2K1 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CC2D2AQ9P2K1 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CC2D2AQ9P2K1 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
CC2D2AQ9P2K1 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CC2D2AQ9P2K1 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CC2D2AQ9P2K1 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CC2D2AQ9P2K1 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CC2D2AQ9P2K1 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CC2D2AQ9P2K1 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms