Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVR7

TBCCD1, TBCC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBCCD1Q9NVR7 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TBCCD1Q9NVR7 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TBCCD1Q9NVR7 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TBCCD1Q9NVR7 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TBCCD1Q9NVR7 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TBCCD1Q9NVR7 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TBCCD1Q9NVR7 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TBCCD1Q9NVR7 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TBCCD1Q9NVR7 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TBCCD1Q9NVR7 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TBCCD1Q9NVR7 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TBCCD1Q9NVR7 HNF1B-204ENST00000617811 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TBCCD1Q9NVR7 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
TBCCD1Q9NVR7 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
TBCCD1Q9NVR7 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TBCCD1Q9NVR7 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms