Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TIMMDC1Q9NPL8 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TIMMDC1Q9NPL8 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TIMMDC1Q9NPL8 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TIMMDC1Q9NPL8 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TIMMDC1Q9NPL8 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TIMMDC1Q9NPL8 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TIMMDC1Q9NPL8 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TIMMDC1Q9NPL8 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TIMMDC1Q9NPL8 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TIMMDC1Q9NPL8 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TIMMDC1Q9NPL8 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TIMMDC1Q9NPL8 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TIMMDC1Q9NPL8 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TIMMDC1Q9NPL8 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TIMMDC1Q9NPL8 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TIMMDC1Q9NPL8 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TIMMDC1Q9NPL8 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TIMMDC1Q9NPL8 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TIMMDC1Q9NPL8 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TIMMDC1Q9NPL8 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TIMMDC1Q9NPL8 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TIMMDC1Q9NPL8 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TIMMDC1Q9NPL8 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TIMMDC1Q9NPL8 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TIMMDC1Q9NPL8 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TIMMDC1Q9NPL8 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TIMMDC1Q9NPL8 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TIMMDC1Q9NPL8 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TIMMDC1Q9NPL8 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TIMMDC1Q9NPL8 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TIMMDC1Q9NPL8 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TIMMDC1Q9NPL8 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TIMMDC1Q9NPL8 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TIMMDC1Q9NPL8 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TIMMDC1Q9NPL8 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TIMMDC1Q9NPL8 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TIMMDC1Q9NPL8 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TIMMDC1Q9NPL8 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TIMMDC1Q9NPL8 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TIMMDC1Q9NPL8 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TIMMDC1Q9NPL8 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TIMMDC1Q9NPL8 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TIMMDC1Q9NPL8 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TIMMDC1Q9NPL8 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TIMMDC1Q9NPL8 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TIMMDC1Q9NPL8 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TIMMDC1Q9NPL8 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TIMMDC1Q9NPL8 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TIMMDC1Q9NPL8 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TIMMDC1Q9NPL8 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TIMMDC1Q9NPL8 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TIMMDC1Q9NPL8 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TIMMDC1Q9NPL8 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TIMMDC1Q9NPL8 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TIMMDC1Q9NPL8 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TIMMDC1Q9NPL8 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TIMMDC1Q9NPL8 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TIMMDC1Q9NPL8 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TIMMDC1Q9NPL8 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TIMMDC1Q9NPL8 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TIMMDC1Q9NPL8 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TIMMDC1Q9NPL8 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TIMMDC1Q9NPL8 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TIMMDC1Q9NPL8 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TIMMDC1Q9NPL8 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TIMMDC1Q9NPL8 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TIMMDC1Q9NPL8 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TIMMDC1Q9NPL8 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TIMMDC1Q9NPL8 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TIMMDC1Q9NPL8 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TIMMDC1Q9NPL8 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TIMMDC1Q9NPL8 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TIMMDC1Q9NPL8 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TIMMDC1Q9NPL8 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TIMMDC1Q9NPL8 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TIMMDC1Q9NPL8 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TIMMDC1Q9NPL8 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TIMMDC1Q9NPL8 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TIMMDC1Q9NPL8 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TIMMDC1Q9NPL8 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TIMMDC1Q9NPL8 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TIMMDC1Q9NPL8 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TIMMDC1Q9NPL8 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TIMMDC1Q9NPL8 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TIMMDC1Q9NPL8 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TIMMDC1Q9NPL8 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TIMMDC1Q9NPL8 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TIMMDC1Q9NPL8 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TIMMDC1Q9NPL8 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TIMMDC1Q9NPL8 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TIMMDC1Q9NPL8 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TIMMDC1Q9NPL8 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TIMMDC1Q9NPL8 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TIMMDC1Q9NPL8 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TIMMDC1Q9NPL8 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TIMMDC1Q9NPL8 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms