Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP72

RAB18, Ras-related protein Rab-18, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB18Q9NP72 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RAB18Q9NP72 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RAB18Q9NP72 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RAB18Q9NP72 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RAB18Q9NP72 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
RAB18Q9NP72 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RAB18Q9NP72 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RAB18Q9NP72 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RAB18Q9NP72 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RAB18Q9NP72 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RAB18Q9NP72 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RAB18Q9NP72 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RAB18Q9NP72 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RAB18Q9NP72 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RAB18Q9NP72 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RAB18Q9NP72 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RAB18Q9NP72 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RAB18Q9NP72 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RAB18Q9NP72 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RAB18Q9NP72 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RAB18Q9NP72 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RAB18Q9NP72 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RAB18Q9NP72 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RAB18Q9NP72 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RAB18Q9NP72 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RAB18Q9NP72 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RAB18Q9NP72 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RAB18Q9NP72 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RAB18Q9NP72 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RAB18Q9NP72 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RAB18Q9NP72 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RAB18Q9NP72 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RAB18Q9NP72 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RAB18Q9NP72 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RAB18Q9NP72 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RAB18Q9NP72 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RAB18Q9NP72 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RAB18Q9NP72 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RAB18Q9NP72 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RAB18Q9NP72 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RAB18Q9NP72 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
RAB18Q9NP72 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
RAB18Q9NP72 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RAB18Q9NP72 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
RAB18Q9NP72 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RAB18Q9NP72 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RAB18Q9NP72 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RAB18Q9NP72 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RAB18Q9NP72 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
RAB18Q9NP72 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
RAB18Q9NP72 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RAB18Q9NP72 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RAB18Q9NP72 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RAB18Q9NP72 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RAB18Q9NP72 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RAB18Q9NP72 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RAB18Q9NP72 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RAB18Q9NP72 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RAB18Q9NP72 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RAB18Q9NP72 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RAB18Q9NP72 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RAB18Q9NP72 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RAB18Q9NP72 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RAB18Q9NP72 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
RAB18Q9NP72 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RAB18Q9NP72 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RAB18Q9NP72 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RAB18Q9NP72 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RAB18Q9NP72 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RAB18Q9NP72 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RAB18Q9NP72 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RAB18Q9NP72 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RAB18Q9NP72 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
RAB18Q9NP72 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RAB18Q9NP72 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RAB18Q9NP72 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RAB18Q9NP72 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RAB18Q9NP72 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RAB18Q9NP72 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RAB18Q9NP72 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RAB18Q9NP72 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RAB18Q9NP72 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
RAB18Q9NP72 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RAB18Q9NP72 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RAB18Q9NP72 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RAB18Q9NP72 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
RAB18Q9NP72 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RAB18Q9NP72 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RAB18Q9NP72 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RAB18Q9NP72 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RAB18Q9NP72 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RAB18Q9NP72 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RAB18Q9NP72 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
RAB18Q9NP72 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RAB18Q9NP72 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RAB18Q9NP72 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
RAB18Q9NP72 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RAB18Q9NP72 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RAB18Q9NP72 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RAB18Q9NP72 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms