Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD26

GOPC, Golgi-associated PDZ and coiled-coil motif-containing protein, humanhuman

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Length 462 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOPCQ9HD26 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GOPCQ9HD26 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GOPCQ9HD26 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GOPCQ9HD26 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GOPCQ9HD26 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GOPCQ9HD26 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GOPCQ9HD26 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GOPCQ9HD26 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GOPCQ9HD26 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GOPCQ9HD26 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GOPCQ9HD26 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GOPCQ9HD26 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GOPCQ9HD26 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GOPCQ9HD26 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GOPCQ9HD26 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GOPCQ9HD26 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GOPCQ9HD26 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GOPCQ9HD26 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GOPCQ9HD26 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GOPCQ9HD26 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GOPCQ9HD26 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GOPCQ9HD26 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GOPCQ9HD26 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GOPCQ9HD26 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GOPCQ9HD26 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GOPCQ9HD26 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GOPCQ9HD26 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GOPCQ9HD26 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GOPCQ9HD26 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GOPCQ9HD26 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GOPCQ9HD26 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GOPCQ9HD26 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GOPCQ9HD26 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GOPCQ9HD26 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GOPCQ9HD26 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GOPCQ9HD26 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GOPCQ9HD26 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GOPCQ9HD26 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GOPCQ9HD26 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GOPCQ9HD26 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GOPCQ9HD26 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GOPCQ9HD26 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GOPCQ9HD26 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GOPCQ9HD26 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GOPCQ9HD26 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GOPCQ9HD26 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GOPCQ9HD26 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GOPCQ9HD26 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GOPCQ9HD26 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GOPCQ9HD26 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GOPCQ9HD26 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GOPCQ9HD26 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GOPCQ9HD26 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GOPCQ9HD26 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GOPCQ9HD26 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GOPCQ9HD26 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GOPCQ9HD26 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GOPCQ9HD26 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GOPCQ9HD26 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GOPCQ9HD26 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GOPCQ9HD26 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GOPCQ9HD26 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GOPCQ9HD26 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GOPCQ9HD26 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GOPCQ9HD26 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GOPCQ9HD26 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GOPCQ9HD26 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GOPCQ9HD26 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GOPCQ9HD26 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GOPCQ9HD26 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GOPCQ9HD26 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GOPCQ9HD26 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GOPCQ9HD26 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GOPCQ9HD26 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GOPCQ9HD26 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GOPCQ9HD26 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GOPCQ9HD26 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GOPCQ9HD26 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GOPCQ9HD26 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GOPCQ9HD26 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GOPCQ9HD26 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GOPCQ9HD26 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GOPCQ9HD26 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GOPCQ9HD26 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GOPCQ9HD26 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GOPCQ9HD26 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GOPCQ9HD26 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GOPCQ9HD26 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GOPCQ9HD26 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GOPCQ9HD26 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GOPCQ9HD26 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GOPCQ9HD26 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GOPCQ9HD26 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GOPCQ9HD26 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GOPCQ9HD26 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GOPCQ9HD26 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GOPCQ9HD26 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GOPCQ9HD26 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GOPCQ9HD26 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GOPCQ9HD26 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
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