Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 LINC01993-201ENST00000374945 2934 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 SLC52A1-203ENST00000512825 2989 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 NTNG1-204ENST00000370067 4628 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 CCDC148-201ENST00000283233 3122 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 GOLGA7B-203ENST00000596005 6378 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 UBE2I-202ENST00000355803 3253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 IGF2BP1-201ENST00000290341 8274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 ATP2C1-221ENST00000513801 3439 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 CNTN2-201ENST00000331830 7999 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 CEACAM20-204ENST00000617951 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 FUT3-207ENST00000589620 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 WDR26-201ENST00000414423 6872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 CAPN13-201ENST00000295055 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 PAX8-202ENST00000263335 3735 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 TSPOAP1-201ENST00000268893 7483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 GRM1-204ENST00000492807 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 SEZ6L-201ENST00000248933 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 CCT2-201ENST00000299300 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 MARCH10-201ENST00000311269 3090 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 AGAP6-202ENST00000412531 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 ODF2-213ENST00000448249 2059 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 TGM7-201ENST00000452443 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 FAM90A26-201ENST00000512047 2492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 CADM1-206ENST00000537058 3550 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 AAGAB-207ENST00000561452 2251 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 EIF3L-214ENST00000624234 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 SEZ6L-210ENST00000629590 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 RAP2B-201ENST00000323534 8351 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 RANBP17-219ENST00000523189 4588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 BAIAP3-203ENST00000421665 3875 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 APLP2-202ENST00000278756 3687 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 MYO16-202ENST00000356711 6874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 POU2AF1-201ENST00000393067 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 MKRN1-201ENST00000255977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 PPFIA4-210ENST00000599966 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 ELOVL4-201ENST00000369816 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 SGSM3-201ENST00000248929 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 ZFYVE27-205ENST00000370613 2669 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 TBX3-202ENST00000349155 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 DUSP14-205ENST00000614411 2207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 PEX1-201ENST00000248633 4385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 TRIM35-201ENST00000305364 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 SLC25A17-217ENST00000544408 2060 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 NPHP3-ACAD11-201ENST00000471702 7784 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 RIPK4-201ENST00000332512 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 RHPN1-AS1-201ENST00000518049 1918 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 AP001999.1-201ENST00000513405 3684 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.5 ms