Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXJ4

C1QTNF3, Complement C1q tumor necrosis factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF3Q9BXJ4 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C1QTNF3Q9BXJ4 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C1QTNF3Q9BXJ4 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C1QTNF3Q9BXJ4 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C1QTNF3Q9BXJ4 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C1QTNF3Q9BXJ4 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C1QTNF3Q9BXJ4 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C1QTNF3Q9BXJ4 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C1QTNF3Q9BXJ4 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C1QTNF3Q9BXJ4 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C1QTNF3Q9BXJ4 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C1QTNF3Q9BXJ4 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C1QTNF3Q9BXJ4 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
C1QTNF3Q9BXJ4 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C1QTNF3Q9BXJ4 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C1QTNF3Q9BXJ4 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C1QTNF3Q9BXJ4 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C1QTNF3Q9BXJ4 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C1QTNF3Q9BXJ4 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C1QTNF3Q9BXJ4 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
C1QTNF3Q9BXJ4 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C1QTNF3Q9BXJ4 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C1QTNF3Q9BXJ4 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C1QTNF3Q9BXJ4 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C1QTNF3Q9BXJ4 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C1QTNF3Q9BXJ4 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C1QTNF3Q9BXJ4 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C1QTNF3Q9BXJ4 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C1QTNF3Q9BXJ4 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
C1QTNF3Q9BXJ4 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C1QTNF3Q9BXJ4 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
C1QTNF3Q9BXJ4 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C1QTNF3Q9BXJ4 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
C1QTNF3Q9BXJ4 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C1QTNF3Q9BXJ4 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C1QTNF3Q9BXJ4 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C1QTNF3Q9BXJ4 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
C1QTNF3Q9BXJ4 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C1QTNF3Q9BXJ4 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C1QTNF3Q9BXJ4 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C1QTNF3Q9BXJ4 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C1QTNF3Q9BXJ4 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C1QTNF3Q9BXJ4 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C1QTNF3Q9BXJ4 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C1QTNF3Q9BXJ4 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C1QTNF3Q9BXJ4 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C1QTNF3Q9BXJ4 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C1QTNF3Q9BXJ4 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C1QTNF3Q9BXJ4 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C1QTNF3Q9BXJ4 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C1QTNF3Q9BXJ4 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C1QTNF3Q9BXJ4 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C1QTNF3Q9BXJ4 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C1QTNF3Q9BXJ4 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C1QTNF3Q9BXJ4 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
C1QTNF3Q9BXJ4 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C1QTNF3Q9BXJ4 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C1QTNF3Q9BXJ4 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C1QTNF3Q9BXJ4 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C1QTNF3Q9BXJ4 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C1QTNF3Q9BXJ4 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C1QTNF3Q9BXJ4 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C1QTNF3Q9BXJ4 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C1QTNF3Q9BXJ4 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C1QTNF3Q9BXJ4 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C1QTNF3Q9BXJ4 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C1QTNF3Q9BXJ4 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C1QTNF3Q9BXJ4 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
C1QTNF3Q9BXJ4 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C1QTNF3Q9BXJ4 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C1QTNF3Q9BXJ4 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
C1QTNF3Q9BXJ4 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C1QTNF3Q9BXJ4 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C1QTNF3Q9BXJ4 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
C1QTNF3Q9BXJ4 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C1QTNF3Q9BXJ4 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C1QTNF3Q9BXJ4 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C1QTNF3Q9BXJ4 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C1QTNF3Q9BXJ4 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C1QTNF3Q9BXJ4 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C1QTNF3Q9BXJ4 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C1QTNF3Q9BXJ4 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C1QTNF3Q9BXJ4 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C1QTNF3Q9BXJ4 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C1QTNF3Q9BXJ4 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C1QTNF3Q9BXJ4 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C1QTNF3Q9BXJ4 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C1QTNF3Q9BXJ4 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C1QTNF3Q9BXJ4 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C1QTNF3Q9BXJ4 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C1QTNF3Q9BXJ4 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
C1QTNF3Q9BXJ4 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C1QTNF3Q9BXJ4 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C1QTNF3Q9BXJ4 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C1QTNF3Q9BXJ4 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C1QTNF3Q9BXJ4 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C1QTNF3Q9BXJ4 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C1QTNF3Q9BXJ4 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
C1QTNF3Q9BXJ4 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C1QTNF3Q9BXJ4 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms