Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BRIP1Q9BX63 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
BRIP1Q9BX63 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
BRIP1Q9BX63 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BRIP1Q9BX63 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BRIP1Q9BX63 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
BRIP1Q9BX63 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
BRIP1Q9BX63 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
BRIP1Q9BX63 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BRIP1Q9BX63 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BRIP1Q9BX63 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
BRIP1Q9BX63 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
BRIP1Q9BX63 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
BRIP1Q9BX63 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
BRIP1Q9BX63 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BRIP1Q9BX63 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
BRIP1Q9BX63 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BRIP1Q9BX63 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BRIP1Q9BX63 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BRIP1Q9BX63 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BRIP1Q9BX63 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BRIP1Q9BX63 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BRIP1Q9BX63 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BRIP1Q9BX63 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BRIP1Q9BX63 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BRIP1Q9BX63 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BRIP1Q9BX63 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BRIP1Q9BX63 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BRIP1Q9BX63 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BRIP1Q9BX63 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BRIP1Q9BX63 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BRIP1Q9BX63 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BRIP1Q9BX63 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BRIP1Q9BX63 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BRIP1Q9BX63 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BRIP1Q9BX63 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BRIP1Q9BX63 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BRIP1Q9BX63 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
BRIP1Q9BX63 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BRIP1Q9BX63 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
BRIP1Q9BX63 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
BRIP1Q9BX63 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BRIP1Q9BX63 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BRIP1Q9BX63 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BRIP1Q9BX63 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BRIP1Q9BX63 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BRIP1Q9BX63 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BRIP1Q9BX63 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BRIP1Q9BX63 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BRIP1Q9BX63 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BRIP1Q9BX63 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BRIP1Q9BX63 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BRIP1Q9BX63 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BRIP1Q9BX63 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BRIP1Q9BX63 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BRIP1Q9BX63 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BRIP1Q9BX63 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BRIP1Q9BX63 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BRIP1Q9BX63 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BRIP1Q9BX63 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BRIP1Q9BX63 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BRIP1Q9BX63 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BRIP1Q9BX63 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BRIP1Q9BX63 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BRIP1Q9BX63 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
BRIP1Q9BX63 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BRIP1Q9BX63 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BRIP1Q9BX63 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BRIP1Q9BX63 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BRIP1Q9BX63 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BRIP1Q9BX63 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BRIP1Q9BX63 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BRIP1Q9BX63 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BRIP1Q9BX63 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
BRIP1Q9BX63 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
BRIP1Q9BX63 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
BRIP1Q9BX63 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
BRIP1Q9BX63 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
BRIP1Q9BX63 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
BRIP1Q9BX63 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
BRIP1Q9BX63 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
BRIP1Q9BX63 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
BRIP1Q9BX63 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
BRIP1Q9BX63 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BRIP1Q9BX63 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
BRIP1Q9BX63 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BRIP1Q9BX63 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BRIP1Q9BX63 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BRIP1Q9BX63 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BRIP1Q9BX63 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BRIP1Q9BX63 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms