Protein–RNA interactions for Protein: Q96DL1

NXPE2, NXPE family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXPE2Q96DL1 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NXPE2Q96DL1 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NXPE2Q96DL1 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NXPE2Q96DL1 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NXPE2Q96DL1 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NXPE2Q96DL1 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NXPE2Q96DL1 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NXPE2Q96DL1 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NXPE2Q96DL1 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NXPE2Q96DL1 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NXPE2Q96DL1 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NXPE2Q96DL1 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NXPE2Q96DL1 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NXPE2Q96DL1 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NXPE2Q96DL1 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NXPE2Q96DL1 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NXPE2Q96DL1 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NXPE2Q96DL1 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NXPE2Q96DL1 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NXPE2Q96DL1 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NXPE2Q96DL1 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NXPE2Q96DL1 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NXPE2Q96DL1 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NXPE2Q96DL1 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NXPE2Q96DL1 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NXPE2Q96DL1 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NXPE2Q96DL1 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NXPE2Q96DL1 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NXPE2Q96DL1 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NXPE2Q96DL1 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NXPE2Q96DL1 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NXPE2Q96DL1 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NXPE2Q96DL1 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NXPE2Q96DL1 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NXPE2Q96DL1 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NXPE2Q96DL1 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NXPE2Q96DL1 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NXPE2Q96DL1 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NXPE2Q96DL1 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NXPE2Q96DL1 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NXPE2Q96DL1 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NXPE2Q96DL1 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NXPE2Q96DL1 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NXPE2Q96DL1 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NXPE2Q96DL1 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NXPE2Q96DL1 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NXPE2Q96DL1 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NXPE2Q96DL1 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NXPE2Q96DL1 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NXPE2Q96DL1 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NXPE2Q96DL1 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NXPE2Q96DL1 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NXPE2Q96DL1 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NXPE2Q96DL1 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NXPE2Q96DL1 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NXPE2Q96DL1 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NXPE2Q96DL1 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NXPE2Q96DL1 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NXPE2Q96DL1 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NXPE2Q96DL1 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NXPE2Q96DL1 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NXPE2Q96DL1 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NXPE2Q96DL1 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NXPE2Q96DL1 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NXPE2Q96DL1 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NXPE2Q96DL1 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NXPE2Q96DL1 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NXPE2Q96DL1 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NXPE2Q96DL1 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NXPE2Q96DL1 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NXPE2Q96DL1 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NXPE2Q96DL1 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NXPE2Q96DL1 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NXPE2Q96DL1 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NXPE2Q96DL1 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NXPE2Q96DL1 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NXPE2Q96DL1 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NXPE2Q96DL1 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NXPE2Q96DL1 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NXPE2Q96DL1 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NXPE2Q96DL1 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NXPE2Q96DL1 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NXPE2Q96DL1 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NXPE2Q96DL1 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NXPE2Q96DL1 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NXPE2Q96DL1 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NXPE2Q96DL1 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NXPE2Q96DL1 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NXPE2Q96DL1 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NXPE2Q96DL1 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NXPE2Q96DL1 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NXPE2Q96DL1 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NXPE2Q96DL1 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NXPE2Q96DL1 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NXPE2Q96DL1 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NXPE2Q96DL1 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NXPE2Q96DL1 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NXPE2Q96DL1 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NXPE2Q96DL1 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NXPE2Q96DL1 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms