Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W8

FAM71D, Protein FAM71D, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71DQ8N9W8 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM71DQ8N9W8 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM71DQ8N9W8 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM71DQ8N9W8 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM71DQ8N9W8 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM71DQ8N9W8 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM71DQ8N9W8 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM71DQ8N9W8 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM71DQ8N9W8 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM71DQ8N9W8 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM71DQ8N9W8 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM71DQ8N9W8 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM71DQ8N9W8 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM71DQ8N9W8 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM71DQ8N9W8 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM71DQ8N9W8 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM71DQ8N9W8 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM71DQ8N9W8 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM71DQ8N9W8 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM71DQ8N9W8 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM71DQ8N9W8 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM71DQ8N9W8 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM71DQ8N9W8 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM71DQ8N9W8 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM71DQ8N9W8 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM71DQ8N9W8 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM71DQ8N9W8 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM71DQ8N9W8 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM71DQ8N9W8 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM71DQ8N9W8 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM71DQ8N9W8 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM71DQ8N9W8 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM71DQ8N9W8 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM71DQ8N9W8 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM71DQ8N9W8 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM71DQ8N9W8 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM71DQ8N9W8 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM71DQ8N9W8 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM71DQ8N9W8 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM71DQ8N9W8 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM71DQ8N9W8 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM71DQ8N9W8 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM71DQ8N9W8 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM71DQ8N9W8 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM71DQ8N9W8 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM71DQ8N9W8 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM71DQ8N9W8 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM71DQ8N9W8 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM71DQ8N9W8 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM71DQ8N9W8 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM71DQ8N9W8 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM71DQ8N9W8 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM71DQ8N9W8 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM71DQ8N9W8 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM71DQ8N9W8 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM71DQ8N9W8 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM71DQ8N9W8 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM71DQ8N9W8 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM71DQ8N9W8 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM71DQ8N9W8 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM71DQ8N9W8 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM71DQ8N9W8 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM71DQ8N9W8 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM71DQ8N9W8 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM71DQ8N9W8 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM71DQ8N9W8 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM71DQ8N9W8 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM71DQ8N9W8 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM71DQ8N9W8 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM71DQ8N9W8 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM71DQ8N9W8 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM71DQ8N9W8 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM71DQ8N9W8 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM71DQ8N9W8 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM71DQ8N9W8 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM71DQ8N9W8 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM71DQ8N9W8 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM71DQ8N9W8 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM71DQ8N9W8 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM71DQ8N9W8 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM71DQ8N9W8 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM71DQ8N9W8 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM71DQ8N9W8 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM71DQ8N9W8 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM71DQ8N9W8 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM71DQ8N9W8 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM71DQ8N9W8 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM71DQ8N9W8 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM71DQ8N9W8 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM71DQ8N9W8 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM71DQ8N9W8 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM71DQ8N9W8 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM71DQ8N9W8 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM71DQ8N9W8 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM71DQ8N9W8 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM71DQ8N9W8 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM71DQ8N9W8 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM71DQ8N9W8 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM71DQ8N9W8 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM71DQ8N9W8 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
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