Protein–RNA interactions for Protein: Q86V81

ALYREF, THO complex subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALYREFQ86V81 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 SERF2-206ENST00000409291 807 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms