Protein–RNA interactions for Protein: Q587I9

SFT2D3, Vesicle transport protein SFT2C, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D3Q587I9 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFT2D3Q587I9 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms