Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAA8

TSNAXIP1, Translin-associated factor X-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNAXIP1Q2TAA8 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSNAXIP1Q2TAA8 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSNAXIP1Q2TAA8 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSNAXIP1Q2TAA8 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSNAXIP1Q2TAA8 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSNAXIP1Q2TAA8 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSNAXIP1Q2TAA8 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TSNAXIP1Q2TAA8 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSNAXIP1Q2TAA8 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSNAXIP1Q2TAA8 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSNAXIP1Q2TAA8 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSNAXIP1Q2TAA8 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSNAXIP1Q2TAA8 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSNAXIP1Q2TAA8 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TSNAXIP1Q2TAA8 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSNAXIP1Q2TAA8 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSNAXIP1Q2TAA8 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSNAXIP1Q2TAA8 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TSNAXIP1Q2TAA8 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TSNAXIP1Q2TAA8 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSNAXIP1Q2TAA8 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSNAXIP1Q2TAA8 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSNAXIP1Q2TAA8 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSNAXIP1Q2TAA8 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSNAXIP1Q2TAA8 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSNAXIP1Q2TAA8 RN7SL371P-201ENST00000578099 267 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TSNAXIP1Q2TAA8 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSNAXIP1Q2TAA8 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TSNAXIP1Q2TAA8 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSNAXIP1Q2TAA8 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSNAXIP1Q2TAA8 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSNAXIP1Q2TAA8 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSNAXIP1Q2TAA8 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSNAXIP1Q2TAA8 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSNAXIP1Q2TAA8 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSNAXIP1Q2TAA8 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSNAXIP1Q2TAA8 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSNAXIP1Q2TAA8 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSNAXIP1Q2TAA8 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSNAXIP1Q2TAA8 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSNAXIP1Q2TAA8 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSNAXIP1Q2TAA8 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSNAXIP1Q2TAA8 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSNAXIP1Q2TAA8 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSNAXIP1Q2TAA8 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TSNAXIP1Q2TAA8 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TSNAXIP1Q2TAA8 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TSNAXIP1Q2TAA8 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TSNAXIP1Q2TAA8 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TSNAXIP1Q2TAA8 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TSNAXIP1Q2TAA8 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TSNAXIP1Q2TAA8 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TSNAXIP1Q2TAA8 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TSNAXIP1Q2TAA8 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TSNAXIP1Q2TAA8 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TSNAXIP1Q2TAA8 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TSNAXIP1Q2TAA8 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TSNAXIP1Q2TAA8 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TSNAXIP1Q2TAA8 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TSNAXIP1Q2TAA8 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TSNAXIP1Q2TAA8 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TSNAXIP1Q2TAA8 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TSNAXIP1Q2TAA8 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TSNAXIP1Q2TAA8 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TSNAXIP1Q2TAA8 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TSNAXIP1Q2TAA8 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TSNAXIP1Q2TAA8 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TSNAXIP1Q2TAA8 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TSNAXIP1Q2TAA8 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TSNAXIP1Q2TAA8 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TSNAXIP1Q2TAA8 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TSNAXIP1Q2TAA8 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TSNAXIP1Q2TAA8 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TSNAXIP1Q2TAA8 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TSNAXIP1Q2TAA8 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TSNAXIP1Q2TAA8 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TSNAXIP1Q2TAA8 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TSNAXIP1Q2TAA8 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TSNAXIP1Q2TAA8 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TSNAXIP1Q2TAA8 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TSNAXIP1Q2TAA8 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TSNAXIP1Q2TAA8 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TSNAXIP1Q2TAA8 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TSNAXIP1Q2TAA8 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TSNAXIP1Q2TAA8 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TSNAXIP1Q2TAA8 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TSNAXIP1Q2TAA8 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TSNAXIP1Q2TAA8 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TSNAXIP1Q2TAA8 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TSNAXIP1Q2TAA8 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TSNAXIP1Q2TAA8 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TSNAXIP1Q2TAA8 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TSNAXIP1Q2TAA8 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TSNAXIP1Q2TAA8 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TSNAXIP1Q2TAA8 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TSNAXIP1Q2TAA8 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TSNAXIP1Q2TAA8 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TSNAXIP1Q2TAA8 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TSNAXIP1Q2TAA8 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TSNAXIP1Q2TAA8 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms