Protein–RNA interactions for Protein: Q15544

TAF11, Transcription initiation factor TFIID subunit 11, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF11Q15544 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TAF11Q15544 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms