Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Length 741 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
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NCAPHQ15003 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NCAPHQ15003 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
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