Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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PEX6Q13608 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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PEX6Q13608 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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PEX6Q13608 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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PEX6Q13608 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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