Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC14.33□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms