Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms