Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SRSF4Q08170 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms