Protein–RNA interactions for Protein: Q06547

GABPB1, GA-binding protein subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1Q06547 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 TFIP11-201ENST00000405938 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 PCDHGB7-202ENST00000612073 2785 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 PFKP-203ENST00000381125 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 MYRIP-204ENST00000444716 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 GNAL-203ENST00000423027 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 PDE9A-201ENST00000291539 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 NFE2L1-218ENST00000583378 2051 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 IFT57-201ENST00000264538 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 SMTN-203ENST00000358743 3198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 RNF220-203ENST00000361799 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 RNF220-204ENST00000372247 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 ACIN1-204ENST00000397341 2738 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 CCDC57-202ENST00000389641 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 CCDC57-206ENST00000392347 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 SPTBN2-210ENST00000611817 2890 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 C17orf53-203ENST00000585683 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 USP49-201ENST00000373006 3177 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 TMPRSS13-202ENST00000445164 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 WARS2-201ENST00000235521 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 PTH2R-201ENST00000272847 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 SLC45A1-201ENST00000289877 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 TRIM80P-201ENST00000455685 2848 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 SLC4A8-205ENST00000535225 2262 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABPB1Q06547 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms