Protein–RNA interactions for Protein: Q04771

ACVR1, Activin receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACVR1Q04771 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACVR1Q04771 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACVR1Q04771 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ACVR1Q04771 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACVR1Q04771 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ACVR1Q04771 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACVR1Q04771 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACVR1Q04771 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACVR1Q04771 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACVR1Q04771 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACVR1Q04771 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACVR1Q04771 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACVR1Q04771 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ACVR1Q04771 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ACVR1Q04771 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACVR1Q04771 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACVR1Q04771 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACVR1Q04771 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACVR1Q04771 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACVR1Q04771 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACVR1Q04771 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACVR1Q04771 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACVR1Q04771 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ACVR1Q04771 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACVR1Q04771 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACVR1Q04771 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACVR1Q04771 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACVR1Q04771 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACVR1Q04771 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACVR1Q04771 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACVR1Q04771 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACVR1Q04771 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACVR1Q04771 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACVR1Q04771 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACVR1Q04771 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACVR1Q04771 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACVR1Q04771 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACVR1Q04771 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACVR1Q04771 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACVR1Q04771 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACVR1Q04771 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACVR1Q04771 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACVR1Q04771 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACVR1Q04771 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACVR1Q04771 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACVR1Q04771 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACVR1Q04771 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ACVR1Q04771 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ACVR1Q04771 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACVR1Q04771 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACVR1Q04771 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACVR1Q04771 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACVR1Q04771 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ACVR1Q04771 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACVR1Q04771 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ACVR1Q04771 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACVR1Q04771 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACVR1Q04771 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACVR1Q04771 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACVR1Q04771 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACVR1Q04771 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACVR1Q04771 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACVR1Q04771 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACVR1Q04771 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACVR1Q04771 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACVR1Q04771 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACVR1Q04771 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACVR1Q04771 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACVR1Q04771 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACVR1Q04771 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACVR1Q04771 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ACVR1Q04771 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACVR1Q04771 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACVR1Q04771 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACVR1Q04771 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACVR1Q04771 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACVR1Q04771 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ACVR1Q04771 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACVR1Q04771 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACVR1Q04771 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACVR1Q04771 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACVR1Q04771 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACVR1Q04771 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACVR1Q04771 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACVR1Q04771 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACVR1Q04771 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACVR1Q04771 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACVR1Q04771 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACVR1Q04771 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACVR1Q04771 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACVR1Q04771 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACVR1Q04771 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ACVR1Q04771 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACVR1Q04771 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACVR1Q04771 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACVR1Q04771 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACVR1Q04771 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ACVR1Q04771 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACVR1Q04771 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACVR1Q04771 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms