Protein–RNA interactions for Protein: P50461

CSRP3, Cysteine and glycine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP3P50461 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSRP3P50461 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms