Protein–RNA interactions for Protein: P15056

BRAF, Serine/threonine-protein kinase B-raf, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRAFP15056 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BRAFP15056 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BRAFP15056 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BRAFP15056 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
BRAFP15056 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BRAFP15056 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BRAFP15056 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BRAFP15056 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BRAFP15056 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BRAFP15056 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BRAFP15056 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BRAFP15056 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BRAFP15056 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BRAFP15056 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BRAFP15056 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BRAFP15056 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BRAFP15056 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BRAFP15056 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BRAFP15056 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BRAFP15056 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BRAFP15056 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BRAFP15056 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
BRAFP15056 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BRAFP15056 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BRAFP15056 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BRAFP15056 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BRAFP15056 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BRAFP15056 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BRAFP15056 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BRAFP15056 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BRAFP15056 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BRAFP15056 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BRAFP15056 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BRAFP15056 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BRAFP15056 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BRAFP15056 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BRAFP15056 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
BRAFP15056 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
BRAFP15056 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BRAFP15056 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BRAFP15056 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
BRAFP15056 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BRAFP15056 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BRAFP15056 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BRAFP15056 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BRAFP15056 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BRAFP15056 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BRAFP15056 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BRAFP15056 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BRAFP15056 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BRAFP15056 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BRAFP15056 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
BRAFP15056 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BRAFP15056 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BRAFP15056 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BRAFP15056 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BRAFP15056 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BRAFP15056 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BRAFP15056 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BRAFP15056 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BRAFP15056 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BRAFP15056 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BRAFP15056 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BRAFP15056 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BRAFP15056 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BRAFP15056 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BRAFP15056 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BRAFP15056 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BRAFP15056 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BRAFP15056 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BRAFP15056 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BRAFP15056 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BRAFP15056 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BRAFP15056 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BRAFP15056 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
BRAFP15056 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BRAFP15056 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BRAFP15056 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BRAFP15056 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BRAFP15056 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BRAFP15056 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BRAFP15056 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BRAFP15056 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BRAFP15056 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BRAFP15056 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BRAFP15056 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BRAFP15056 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BRAFP15056 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BRAFP15056 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BRAFP15056 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BRAFP15056 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BRAFP15056 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BRAFP15056 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BRAFP15056 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BRAFP15056 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BRAFP15056 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BRAFP15056 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BRAFP15056 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BRAFP15056 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BRAFP15056 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms