Protein–RNA interactions for Protein: P0DP24

CALM2, Calmodulin-2, humanhuman

Predictions only

Length 149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALM2P0DP24 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CALM2P0DP24 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CALM2P0DP24 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CALM2P0DP24 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CALM2P0DP24 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CALM2P0DP24 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CALM2P0DP24 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CALM2P0DP24 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CALM2P0DP24 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CALM2P0DP24 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CALM2P0DP24 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CALM2P0DP24 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CALM2P0DP24 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CALM2P0DP24 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CALM2P0DP24 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CALM2P0DP24 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CALM2P0DP24 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CALM2P0DP24 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CALM2P0DP24 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CALM2P0DP24 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CALM2P0DP24 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CALM2P0DP24 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CALM2P0DP24 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CALM2P0DP24 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CALM2P0DP24 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CALM2P0DP24 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CALM2P0DP24 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CALM2P0DP24 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CALM2P0DP24 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CALM2P0DP24 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CALM2P0DP24 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CALM2P0DP24 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CALM2P0DP24 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CALM2P0DP24 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CALM2P0DP24 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CALM2P0DP24 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CALM2P0DP24 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CALM2P0DP24 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CALM2P0DP24 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CALM2P0DP24 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CALM2P0DP24 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CALM2P0DP24 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CALM2P0DP24 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CALM2P0DP24 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CALM2P0DP24 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CALM2P0DP24 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CALM2P0DP24 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CALM2P0DP24 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CALM2P0DP24 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CALM2P0DP24 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CALM2P0DP24 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CALM2P0DP24 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CALM2P0DP24 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CALM2P0DP24 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CALM2P0DP24 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CALM2P0DP24 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CALM2P0DP24 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CALM2P0DP24 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CALM2P0DP24 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CALM2P0DP24 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CALM2P0DP24 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CALM2P0DP24 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CALM2P0DP24 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CALM2P0DP24 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CALM2P0DP24 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CALM2P0DP24 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CALM2P0DP24 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CALM2P0DP24 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CALM2P0DP24 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CALM2P0DP24 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CALM2P0DP24 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CALM2P0DP24 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CALM2P0DP24 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CALM2P0DP24 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CALM2P0DP24 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CALM2P0DP24 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CALM2P0DP24 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CALM2P0DP24 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CALM2P0DP24 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CALM2P0DP24 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CALM2P0DP24 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CALM2P0DP24 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CALM2P0DP24 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CALM2P0DP24 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CALM2P0DP24 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CALM2P0DP24 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CALM2P0DP24 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CALM2P0DP24 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CALM2P0DP24 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CALM2P0DP24 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CALM2P0DP24 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CALM2P0DP24 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CALM2P0DP24 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CALM2P0DP24 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CALM2P0DP24 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CALM2P0DP24 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CALM2P0DP24 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CALM2P0DP24 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CALM2P0DP24 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CALM2P0DP24 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms