Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR1AO95602 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR1AO95602 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR1AO95602 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR1AO95602 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR1AO95602 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR1AO95602 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR1AO95602 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR1AO95602 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR1AO95602 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR1AO95602 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR1AO95602 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR1AO95602 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR1AO95602 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR1AO95602 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR1AO95602 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR1AO95602 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR1AO95602 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR1AO95602 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR1AO95602 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR1AO95602 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR1AO95602 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR1AO95602 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR1AO95602 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR1AO95602 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR1AO95602 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR1AO95602 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR1AO95602 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR1AO95602 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR1AO95602 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR1AO95602 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR1AO95602 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR1AO95602 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR1AO95602 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR1AO95602 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR1AO95602 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR1AO95602 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR1AO95602 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR1AO95602 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR1AO95602 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR1AO95602 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR1AO95602 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR1AO95602 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR1AO95602 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR1AO95602 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR1AO95602 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR1AO95602 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR1AO95602 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR1AO95602 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR1AO95602 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR1AO95602 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR1AO95602 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR1AO95602 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR1AO95602 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR1AO95602 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR1AO95602 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR1AO95602 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR1AO95602 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR1AO95602 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR1AO95602 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR1AO95602 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR1AO95602 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR1AO95602 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR1AO95602 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR1AO95602 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR1AO95602 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR1AO95602 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR1AO95602 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR1AO95602 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR1AO95602 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR1AO95602 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR1AO95602 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR1AO95602 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR1AO95602 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR1AO95602 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR1AO95602 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR1AO95602 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR1AO95602 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR1AO95602 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR1AO95602 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR1AO95602 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR1AO95602 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR1AO95602 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR1AO95602 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR1AO95602 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR1AO95602 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR1AO95602 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR1AO95602 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR1AO95602 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR1AO95602 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR1AO95602 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR1AO95602 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR1AO95602 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR1AO95602 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR1AO95602 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR1AO95602 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR1AO95602 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR1AO95602 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR1AO95602 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR1AO95602 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms