Protein–RNA interactions for Protein: O95573

ACSL3, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 3, humanhuman

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSL3O95573 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACSL3O95573 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ACSL3O95573 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ACSL3O95573 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACSL3O95573 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACSL3O95573 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
ACSL3O95573 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
ACSL3O95573 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
ACSL3O95573 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACSL3O95573 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACSL3O95573 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACSL3O95573 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACSL3O95573 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACSL3O95573 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACSL3O95573 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACSL3O95573 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACSL3O95573 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACSL3O95573 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACSL3O95573 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACSL3O95573 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACSL3O95573 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACSL3O95573 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACSL3O95573 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACSL3O95573 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACSL3O95573 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACSL3O95573 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACSL3O95573 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACSL3O95573 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACSL3O95573 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACSL3O95573 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACSL3O95573 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACSL3O95573 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACSL3O95573 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACSL3O95573 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACSL3O95573 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACSL3O95573 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACSL3O95573 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ACSL3O95573 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACSL3O95573 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACSL3O95573 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACSL3O95573 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACSL3O95573 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACSL3O95573 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACSL3O95573 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACSL3O95573 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACSL3O95573 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACSL3O95573 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACSL3O95573 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACSL3O95573 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACSL3O95573 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACSL3O95573 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACSL3O95573 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACSL3O95573 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACSL3O95573 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACSL3O95573 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ACSL3O95573 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACSL3O95573 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACSL3O95573 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACSL3O95573 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACSL3O95573 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACSL3O95573 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACSL3O95573 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACSL3O95573 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACSL3O95573 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACSL3O95573 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACSL3O95573 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACSL3O95573 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACSL3O95573 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACSL3O95573 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACSL3O95573 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACSL3O95573 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACSL3O95573 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACSL3O95573 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACSL3O95573 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACSL3O95573 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACSL3O95573 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACSL3O95573 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ACSL3O95573 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ACSL3O95573 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACSL3O95573 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACSL3O95573 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACSL3O95573 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACSL3O95573 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACSL3O95573 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACSL3O95573 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACSL3O95573 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACSL3O95573 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACSL3O95573 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACSL3O95573 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACSL3O95573 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACSL3O95573 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACSL3O95573 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACSL3O95573 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACSL3O95573 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACSL3O95573 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACSL3O95573 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACSL3O95573 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACSL3O95573 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACSL3O95573 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACSL3O95573 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms