Protein–RNA interactions for Protein: O43741

PRKAB2, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAB2O43741 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PRKAB2O43741 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PRKAB2O43741 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PRKAB2O43741 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PRKAB2O43741 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PRKAB2O43741 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PRKAB2O43741 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRKAB2O43741 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRKAB2O43741 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRKAB2O43741 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRKAB2O43741 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRKAB2O43741 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRKAB2O43741 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRKAB2O43741 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRKAB2O43741 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRKAB2O43741 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRKAB2O43741 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRKAB2O43741 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRKAB2O43741 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRKAB2O43741 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRKAB2O43741 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRKAB2O43741 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRKAB2O43741 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRKAB2O43741 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRKAB2O43741 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRKAB2O43741 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRKAB2O43741 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRKAB2O43741 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PRKAB2O43741 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRKAB2O43741 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRKAB2O43741 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRKAB2O43741 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRKAB2O43741 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRKAB2O43741 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRKAB2O43741 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRKAB2O43741 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRKAB2O43741 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRKAB2O43741 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRKAB2O43741 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRKAB2O43741 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRKAB2O43741 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRKAB2O43741 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRKAB2O43741 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRKAB2O43741 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRKAB2O43741 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRKAB2O43741 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRKAB2O43741 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRKAB2O43741 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRKAB2O43741 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRKAB2O43741 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PRKAB2O43741 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRKAB2O43741 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRKAB2O43741 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRKAB2O43741 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRKAB2O43741 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRKAB2O43741 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRKAB2O43741 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PRKAB2O43741 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRKAB2O43741 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRKAB2O43741 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRKAB2O43741 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRKAB2O43741 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRKAB2O43741 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRKAB2O43741 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRKAB2O43741 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PRKAB2O43741 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRKAB2O43741 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRKAB2O43741 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRKAB2O43741 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRKAB2O43741 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRKAB2O43741 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRKAB2O43741 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRKAB2O43741 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRKAB2O43741 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PRKAB2O43741 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRKAB2O43741 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PRKAB2O43741 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRKAB2O43741 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PRKAB2O43741 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PRKAB2O43741 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRKAB2O43741 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRKAB2O43741 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRKAB2O43741 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRKAB2O43741 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRKAB2O43741 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRKAB2O43741 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRKAB2O43741 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRKAB2O43741 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRKAB2O43741 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRKAB2O43741 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRKAB2O43741 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRKAB2O43741 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRKAB2O43741 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRKAB2O43741 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRKAB2O43741 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRKAB2O43741 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRKAB2O43741 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRKAB2O43741 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRKAB2O43741 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRKAB2O43741 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms