Protein–RNA interactions for Protein: O43248

HOXC11, Homeobox protein Hox-C11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC11O43248 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC11O43248 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC11O43248 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC11O43248 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC11O43248 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC11O43248 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC11O43248 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC11O43248 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC11O43248 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC11O43248 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC11O43248 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC11O43248 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC11O43248 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC11O43248 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC11O43248 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC11O43248 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC11O43248 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC11O43248 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC11O43248 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC11O43248 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC11O43248 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC11O43248 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC11O43248 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC11O43248 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC11O43248 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC11O43248 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC11O43248 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC11O43248 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC11O43248 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXC11O43248 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXC11O43248 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXC11O43248 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXC11O43248 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXC11O43248 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXC11O43248 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXC11O43248 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXC11O43248 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXC11O43248 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXC11O43248 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXC11O43248 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXC11O43248 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXC11O43248 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXC11O43248 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXC11O43248 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXC11O43248 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXC11O43248 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXC11O43248 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXC11O43248 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXC11O43248 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXC11O43248 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXC11O43248 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXC11O43248 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXC11O43248 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXC11O43248 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXC11O43248 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXC11O43248 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXC11O43248 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXC11O43248 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXC11O43248 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXC11O43248 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXC11O43248 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXC11O43248 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXC11O43248 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXC11O43248 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXC11O43248 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXC11O43248 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXC11O43248 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXC11O43248 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXC11O43248 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXC11O43248 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXC11O43248 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXC11O43248 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXC11O43248 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXC11O43248 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXC11O43248 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXC11O43248 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXC11O43248 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXC11O43248 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXC11O43248 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXC11O43248 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXC11O43248 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXC11O43248 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXC11O43248 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXC11O43248 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXC11O43248 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXC11O43248 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXC11O43248 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXC11O43248 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXC11O43248 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXC11O43248 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXC11O43248 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXC11O43248 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXC11O43248 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXC11O43248 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXC11O43248 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXC11O43248 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXC11O43248 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXC11O43248 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXC11O43248 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXC11O43248 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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