Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRTO14522 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRTO14522 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRTO14522 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRTO14522 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRTO14522 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRTO14522 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRTO14522 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRTO14522 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRTO14522 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRTO14522 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRTO14522 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRTO14522 AC010234.1-201ENST00000494599 870 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRTO14522 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRTO14522 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRTO14522 ZNF586-204ENST00000598183 603 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRTO14522 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRTO14522 LINC00969-257ENST00000625632 898 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRTO14522 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRTO14522 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRTO14522 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRTO14522 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRTO14522 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRTO14522 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRTO14522 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRTO14522 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRTO14522 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRTO14522 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRTO14522 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRTO14522 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRTO14522 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRTO14522 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRTO14522 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRTO14522 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRTO14522 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRTO14522 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRTO14522 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRTO14522 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRTO14522 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRTO14522 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRTO14522 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRTO14522 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRTO14522 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRTO14522 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRTO14522 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRTO14522 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRTO14522 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRTO14522 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRTO14522 AC073094.1-201ENST00000453798 433 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRTO14522 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRTO14522 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRTO14522 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRTO14522 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRTO14522 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRTO14522 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRTO14522 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRTO14522 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRTO14522 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRTO14522 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRTO14522 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRTO14522 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRTO14522 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRTO14522 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRTO14522 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRTO14522 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRTO14522 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRTO14522 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRTO14522 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRTO14522 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRTO14522 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRTO14522 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRTO14522 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRTO14522 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRTO14522 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRTO14522 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRTO14522 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRTO14522 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRTO14522 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRTO14522 IDS-203ENST00000428056 1213 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRTO14522 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRTO14522 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRTO14522 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRTO14522 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRTO14522 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRTO14522 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRTO14522 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRTO14522 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRTO14522 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRTO14522 PIGF-202ENST00000306465 1061 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRTO14522 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRTO14522 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRTO14522 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRTO14522 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRTO14522 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRTO14522 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRTO14522 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRTO14522 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRTO14522 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRTO14522 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRTO14522 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
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