Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 SPOCD1-201ENST00000257100 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EBAG9O00559 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 RNF216-202ENST00000389902 3293 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms