Protein–RNA interactions for Protein: O00124

UBXN8, UBX domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8O00124 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
UBXN8O00124 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
UBXN8O00124 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
UBXN8O00124 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
UBXN8O00124 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
UBXN8O00124 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
UBXN8O00124 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
UBXN8O00124 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
UBXN8O00124 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
UBXN8O00124 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
UBXN8O00124 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
UBXN8O00124 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
UBXN8O00124 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
UBXN8O00124 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
UBXN8O00124 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBXN8O00124 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBXN8O00124 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBXN8O00124 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBXN8O00124 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBXN8O00124 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBXN8O00124 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBXN8O00124 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBXN8O00124 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
UBXN8O00124 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBXN8O00124 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBXN8O00124 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBXN8O00124 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBXN8O00124 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBXN8O00124 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBXN8O00124 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBXN8O00124 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBXN8O00124 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBXN8O00124 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBXN8O00124 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBXN8O00124 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBXN8O00124 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
UBXN8O00124 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
UBXN8O00124 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBXN8O00124 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBXN8O00124 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBXN8O00124 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBXN8O00124 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBXN8O00124 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
UBXN8O00124 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBXN8O00124 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBXN8O00124 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBXN8O00124 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBXN8O00124 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBXN8O00124 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBXN8O00124 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBXN8O00124 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBXN8O00124 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBXN8O00124 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBXN8O00124 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBXN8O00124 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBXN8O00124 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBXN8O00124 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBXN8O00124 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBXN8O00124 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 135 ms