Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 ZMYM3-207ENST00000373998 6067 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 CHRFAM7A-201ENST00000299847 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 HECTD1-219ENST00000611816 8980 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 USP40-208ENST00000450966 5616 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 PDE4DIP-227ENST00000529945 8824 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 UHMK1-203ENST00000538489 8446 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 NEU3-201ENST00000294064 6728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 ASXL1-201ENST00000306058 6591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
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