Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W7

KCNIP3, Calsenilin, humanhuman

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Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP3Q9Y2W7 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
KCNIP3Q9Y2W7 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
KCNIP3Q9Y2W7 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
KCNIP3Q9Y2W7 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
KCNIP3Q9Y2W7 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
KCNIP3Q9Y2W7 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
KCNIP3Q9Y2W7 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
KCNIP3Q9Y2W7 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
KCNIP3Q9Y2W7 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
KCNIP3Q9Y2W7 AFF1-201ENST00000307808 9390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
KCNIP3Q9Y2W7 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
KCNIP3Q9Y2W7 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
KCNIP3Q9Y2W7 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
KCNIP3Q9Y2W7 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
KCNIP3Q9Y2W7 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
KCNIP3Q9Y2W7 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
KCNIP3Q9Y2W7 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
KCNIP3Q9Y2W7 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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KCNIP3Q9Y2W7 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC13.25□□□□□ -0.29
KCNIP3Q9Y2W7 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
KCNIP3Q9Y2W7 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
KCNIP3Q9Y2W7 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
KCNIP3Q9Y2W7 KLHL9-201ENST00000359039 5710 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
KCNIP3Q9Y2W7 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
KCNIP3Q9Y2W7 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
KCNIP3Q9Y2W7 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
KCNIP3Q9Y2W7 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
KCNIP3Q9Y2W7 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
KCNIP3Q9Y2W7 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
KCNIP3Q9Y2W7 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
KCNIP3Q9Y2W7 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
KCNIP3Q9Y2W7 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
KCNIP3Q9Y2W7 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
KCNIP3Q9Y2W7 ALX4-201ENST00000329255 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
KCNIP3Q9Y2W7 OR2C3-204ENST00000641802 8509 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
KCNIP3Q9Y2W7 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
KCNIP3Q9Y2W7 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
KCNIP3Q9Y2W7 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
KCNIP3Q9Y2W7 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
KCNIP3Q9Y2W7 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
KCNIP3Q9Y2W7 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
KCNIP3Q9Y2W7 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
KCNIP3Q9Y2W7 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
KCNIP3Q9Y2W7 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
KCNIP3Q9Y2W7 NRXN1-207ENST00000404971 7578 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
KCNIP3Q9Y2W7 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
KCNIP3Q9Y2W7 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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KCNIP3Q9Y2W7 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
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KCNIP3Q9Y2W7 GRWD1-201ENST00000253237 5571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
KCNIP3Q9Y2W7 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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KCNIP3Q9Y2W7 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
KCNIP3Q9Y2W7 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
KCNIP3Q9Y2W7 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
KCNIP3Q9Y2W7 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
KCNIP3Q9Y2W7 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
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KCNIP3Q9Y2W7 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
KCNIP3Q9Y2W7 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
KCNIP3Q9Y2W7 DOCK4-206ENST00000437633 6212 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
KCNIP3Q9Y2W7 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
KCNIP3Q9Y2W7 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
KCNIP3Q9Y2W7 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
KCNIP3Q9Y2W7 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
KCNIP3Q9Y2W7 LRCH3-206ENST00000438796 7394 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
KCNIP3Q9Y2W7 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
KCNIP3Q9Y2W7 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
KCNIP3Q9Y2W7 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
KCNIP3Q9Y2W7 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
KCNIP3Q9Y2W7 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
KCNIP3Q9Y2W7 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
KCNIP3Q9Y2W7 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
KCNIP3Q9Y2W7 ZDHHC15-201ENST00000373367 5796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
KCNIP3Q9Y2W7 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
KCNIP3Q9Y2W7 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
KCNIP3Q9Y2W7 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
KCNIP3Q9Y2W7 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
KCNIP3Q9Y2W7 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
KCNIP3Q9Y2W7 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
KCNIP3Q9Y2W7 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
KCNIP3Q9Y2W7 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
KCNIP3Q9Y2W7 GDPGP1-202ENST00000558017 5323 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
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